Les principales différences sont que les juifs messianiques ne croient pas que Jésus a fondé l'Église catholique en tant qu'accomplissement de l'ancienne alliance d'Israël dans le cadre de la nouvelle alliance. Par conséquent, ils ne reconnaissent pas saint Pierre comme le premier pape, ni les évêques comme des successeurs apostoliques en général, ni les évêques de Rome comme des successeurs de Pierre en particulier.

Ainsi, comme pour d'autres formes de protestantisme, les juifs messianiques manifestent le problème de l'interprétation autoritaire de l'Écriture sans un magistère ordonné par Dieu. Comme je l'indique dans mon article "La Pentecôte et la papauté", les catholiques s'appuient sur le témoignage de Jésus et de l'Église primitive pour obtenir des directives définitives.

Une autre différence majeure est que les juifs messianiques ne reconnaissent pas la plupart des sacrements, y compris le sacerdoce et l'Eucharistie. Ils considéreraient leurs services de communion comme une simple commémoration de ce que Jésus a fait lors de la dernière Cène. Les catholiques savent que le sacrifice de la messe rend présent l'unique sacrifice du Calvaire, qui a culminé dans la gloire éternelle dans le sanctuaire céleste, et a définitivement accompli les anciens sacrifices de la Pâque et du Yom Kippour.

Pour en savoir plus sur la manière dont l'Église primitive croyait en l'Eucharistie, voir cet article.