La question de savoir dans quelle mesure Jean-Baptiste et Jésus se sont connus reste ouverte. Si Marie et Élisabeth se connaissaient manifestement (Luc 1:39), l'Évangile ne nous donne aucune indication sur leur degré de proximité et sur le fait que leurs enfants auraient passé beaucoup de temps ensemble en grandissant.

Il y a de nombreuses raisons pour lesquelles Jésus et Jean-Baptiste n'ont pas passé beaucoup de temps ensemble. Peut-être Marie et Élisabeth n'étaient-elles pas très proches et ne passaient-elles pas de temps ensemble en dehors des réunions de famille. Peut-être qu'Élisabeth et Zacharie sont morts lorsque Jean-Baptiste était très jeune et qu'il a été envoyé chez des parents qui vivaient plus loin, et que Marie avait encore moins de liens avec eux. Peut-être qu'après le massacre d'Hérode, les deux familles ont décidé qu'il valait mieux rester à l'écart l'une de l'autre.

Dans l'Évangile de Jean, Jean le Baptiste nie explicitement avoir connu Jésus autrement que par l'inspiration du Saint-Esprit (Jean 1:31-32).

En revanche, dans l'Évangile de Matthieu, Jean, dès qu'il a vu Jésus, s'est déclaré indigne de baptiser Jésus (Matt. 3:14).

Il est également tout à fait possible que Jean ait su qui était Jésus et qu'il avait une mission spéciale de Dieu, mais qu'il n'en ait pas compris toutes les implications jusqu'à ce que l'Esprit Saint descende sur Jésus comme une colombe.