La question de savoir si saint Joseph savait que Marie avait été conçue par l'Esprit Saint reste ouverte. Les premiers Pères de l'Église sont divisés sur la question de savoir ce que pensait saint Joseph. Certains pensent qu'il pensait que Marie avait été infidèle (Ambroise, Jean Chrysostome, Augustin), tandis que d'autres soutiennent que saint Joseph croyait que Marie lui avait été fidèle et qu'il trouvait donc la grossesse inexplicable (Jérôme, Rabanus Maurus). Selon une autre théorie, saint Joseph savait que l'enfant avait été conçu par le Saint-Esprit et craignait pieusement de prendre Marie pour épouse (Origène, Thomas d'Aquin).

Bien qu'il existe plusieurs théories sur ce que pensait saint Joseph, la tradition ne suggère nulle part qu'il ait entendu que l'enfant avait été conçu par le Saint-Esprit et qu'il en ait douté.