La réponse courte à votre question est non, le Confiteor ne remplace pas le sacrement de la réconciliation pour la rémission des péchés mortels. Le Catéchisme de l'Église catholique le précise au paragraphe 1385 :
Pour répondre à cette invitation, nous devons nous préparer à ce moment si grand et si saint. Saint Paul nous invite à faire un examen de conscience : "Quiconque mange le pain ou boit la coupe du Seigneur d'une manière indigne se rendra coupable de profaner le corps et le sang du Seigneur. Que l'homme s'examine lui-même, et qu'il mange du pain et boive de la coupe. Car quiconque mange et boit sans discerner le corps mange et boit un jugement sur lui-même". Toute personne consciente d'un péché grave doit recevoir le sacrement de réconciliation avant de communier (souligné par nous).
Si vous êtes conscient d'avoir commis un péché grave avant de recevoir la Sainte Communion, vous devez vous en abstenir jusqu'à ce que vous ayez eu recours au sacrement de la réconciliation.