Au contraire, le pape François s'est fermement prononcé contre la franc-maçonnerie et son impact sur l'Église catholique, notamment dans ses remarques finales lors d'une conférence de presse en vol en juillet 2013, dans un discours aux enfants et aux jeunes à Turin, en Italie, en 2015, et à propos de la réforme des Chevaliers de Malte en 2017.