Oui, les apôtres pratiquaient la confession, ayant reçu de Jésus lui-même le pouvoir de pardonner les péchés le jour où il est ressuscité des morts :

Le soir de ce jour-là, le premier de la semaine, les portes étant fermées là où se trouvaient les disciples, par crainte des Juifs, Jésus vint, se présenta au milieu d'eux et leur dit : "La paix soit avec vous." En disant cela, il leur montra ses mains et son côté. Les disciples se réjouirent de voir le Seigneur. Jésus leur dit encore : "La paix soit avec vous. Comme le Père m'a envoyé, moi aussi je vous envoie." Après avoir dit cela, il souffla sur eux et leur dit : "Recevez l'Esprit Saint. Si vous pardonnez les péchés de quelqu'un, ils lui sont pardonnés ; si vous retenez les péchés de quelqu'un, ils lui sont retenus" (Jean 20,19-23).

Malgré les affirmations contraires, l'Église a condamné l'enseignement selon lequel les apôtres n'ont pas reconnu et célébré ce sacrement. Voir cet article de l'Encyclopédie catholique, en particulier la section "Croyances et pratiques de l'Église primitive".