Oui, c'était une pratique assez courante dans de nombreuses cultures catholiques jusqu'au milieu du 20e siècle. Bien que le Code de droit canonique de 1917 n'exigeait pas la séparation des hommes et des femmes à la messe, il la recommandait (canon 1262 §1). Le code de 1983 ne mentionne pas du tout cette pratique.

La pratique est ancienne. Elle est explicitement mentionnée au 4e siècle par saint Cyrille de Jérusalem et saint Augustin. Elle a très probablement été héritée et reprise de la même pratique des anciennes synagogues.

De nombreuses églises plus anciennes ont une statue de saint Joseph d'un côté de l'autel principal et une statue de la Sainte Mère de l'autre côté, vestige de l'époque où cette pratique était plus courante. Certaines églises plus anciennes ont même toutes les images de saints masculins d'un côté et de saints féminins de l'autre.

La pratique semble avoir été courante dans certaines régions et pas dans d'autres. Il serait difficile de parler d'une coutume universelle, mais elle n'était certainement pas rare.