Oui, votre fille peut être baptisée et il n'est pas nécessaire que le père figure dans l'acte sacramentel s'il n'est mentionné dans aucun document public.

Canon 877 (soulignement ajouté) :

§1. Le curé du lieu où le baptême est célébré doit inscrire soigneusement et sans délai dans le registre des baptêmes les noms des baptisés, avec mention du ministre, des parents, des parrains et marraines, des témoins éventuels, du lieu et de la date de la collation du baptême, ainsi que de la date et du lieu de la naissance.

§2. S'il s'agit d'un enfant né d'une mère non mariée, le nom de la mère doit être inscrit, si sa maternité est établie publiquement ou si elle le demande volontairement par écrit ou devant deux témoins. En outre, le nom du père doit être inscrit si un document public ou sa propre déclaration devant le curé et deux témoins prouve sa paternité ; dans les autres cas, le nom du baptisé est inscrit sans mention du nom du père ou des parents.