Melchizédek n'est pas Jésus ; il est une représentation ou une préfiguration de Jésus.

Il ne fait qu'une brève apparition (Gen. 14:18-20) lorsqu'il offre un sacrifice de pain et de vin et accepte l'offrande de la dîme d'Abram (qui s'appellera plus tard Abraham). Parce qu'il apparaît mystérieusement et que la Bible ne donne aucun récit de son origine ou de sa disparition, le livre de la Genèse donne l'impression qu'il était un prêtre éternel sans commencement ni fin (Héb. 7:1-3). Son nom n'est d'ailleurs pas vraiment un nom mais plutôt un titre ("roi de justice").

La raison pour laquelle Jésus n'est pas identifié comme Melchizédek est que le Psaume 110 déclare que le Messie est un prêtre dans "l'ordre" ou "à la manière" de Melchizédek. Il ne dit pas que le Messie est Melchizédek. Hébreux 7:3 déclare que Melchizédek "ressemble" au Fils de Dieu, et non qu'il est le Fils de Dieu. Jésus ressemble en effet à Melchizédek en ce qu'il est sans commencement ni fin et qu'il offre un sacrifice de pain et de vin.

L'Église n'a jamais enseigné de manière définitive qui était exactement Melchizédek. Elle laisse ouverte la possibilité qu'il s'agisse d'un être humain normal ou peut-être d'un ange (parfois identifié à saint Michel).