Il s'agit d'une question de droit canonique. Les Églises orthodoxes orientales sont des Églises complètement séparées. Tout comme les Églises catholiques orientales sont séparées de l'Église latine, mais dans ce cas, elles sont en communion les unes avec les autres.

Le clergé de la FSSPX est un clergé de l'Église latine. En tant que tel, il est lié par le droit canonique de l'Église latine. Le clergé des Églises orthodoxes orientales n'est pas soumis au droit canonique de l'Église latine.

Le droit canonique exige que les prêtres aient ce que l'on appelle des "facultés" afin d'entendre validement les confessions (can. 966 §1). Les prêtres obtiennent généralement ces facultés par l'intermédiaire de leur ordinaire local. Le clergé de la FSSPX n'étant pas en pleine communion avec le pape, il avait essentiellement le statut d'un prêtre suspendu et n'avait donc pas la faculté d'entendre validement les confessions. Toutefois, comme vous l'avez noté, le Saint-Père leur a récemment accordé cette faculté.