Il est probable que Jésus a pleuré par amour et sympathie pour Lazare et sa famille. Cela se produit dans le contexte des pleurs de Marthe et des Juifs qui l'accompagnent (Jean 11:33). Jean nous dit qu'en réponse à leur chagrin, Jésus a été "bouleversé en esprit et troublé" (v. 34). Les personnes présentes ont pris ses pleurs pour un signe d'amitié : Les Juifs disaient : "Voyez comme il l'aimait" (v. 36).
Une autre explication possible est que Jésus a pleuré à cause de la mort humaine que le péché a provoquée dans sa création. Selon W. Leonard dans A Catholic Commentary on Holy Scripture, lorsque Jésus dit "ôte la pierre", le verbe grec utilisé suggère que Jésus était en colère. L'implication est que Jésus était en colère contre la mort, un effet du péché originel d'Adam et d'Ève.
Un tel détail semble frivole à première vue. Mais il révèle un profond mystère théologique : "Jésus, qui s'est fait homme à tous égards sauf pour le péché, a connu toute la gamme des émotions humaines" (Ignatius Catholic Study Bible, 184).